| 3. Jornada | 11.03.2012 | Cienciano | - | León de Huánuco | 2:3 | ||||
| 4. Jornada | 18.03.2012 | Real Garcilaso | - | Cienciano | 1:0 | ||||
| 5. Jornada | 25.03.2012 | Cienciano | - | Universidad San Martín | 2:0 | ||||
| 6. Jornada | 01.04.2012 | César Vallejo | - | Cienciano | 1:0 | ||||
| 9. Jornada | 22.04.2012 | Cienciano | - | Sport Huancayo | 2:2 | ||||
| 10. Jornada | 29.04.2012 | Alianza Lima | - | Cienciano | 2:1 | ||||
| 19. Jornada | 01.07.2012 | Cienciano | - | Real Garcilaso | 2:0 |  |
|||
| 20. Jornada | 05.07.2012 | Universidad San Martín | - | Cienciano | 3:2 | ||||
| 21. Jornada | 08.07.2012 | Cienciano | - | César Vallejo | 2:0 | ||||
| 22. Jornada | 11.07.2012 | Unión Comercio | - | Cienciano | 2:0 | ||||
| 23. Jornada | 15.07.2012 | Cienciano | - | FBC Melgar | 2:0 |
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