| 2. Jornada | 19.03.2000 | FC Sion | - | FC Aarau | 2:0 | ||||
| 3. Jornada | 26.03.2000 | FC Aarau | - | FC Baden | 2:0 |  |
|||
| 4. Jornada | 02.04.2000 | FC Lugano | - | FC Aarau | 3:2 | ||||
| 5. Jornada | 09.04.2000 | AC Bellinzona | - | FC Aarau | 2:2 | ||||
| 6. Jornada | 16.04.2000 | FC Aarau | - | FC Thun | 2:0 | ||||
| 7. Jornada | 20.04.2000 | FC Aarau | - | SR Delémont | 5:2 | ||||
| 8. Jornada | 29.04.2000 | SR Delémont | - | FC Aarau | 0:1 | ||||
| 9. Jornada | 06.05.2000 | FC Thun | - | FC Aarau | 1:0 | ||||
| 10. Jornada | 13.05.2000 | FC Aarau | - | AC Bellinzona | 1:1 | ||||
| 11. Jornada | 20.05.2000 | FC Aarau | - | FC Lugano | 2:2 | ||||
| 12. Jornada | 27.05.2000 | FC Baden | - | FC Aarau | 1:3 | ||||
| 13. Jornada | 04.06.2000 | FC Aarau | - | FC Sion | 3:1 | |
|||
| 14. Jornada | 07.06.2000 | FC Zürich | - | FC Aarau | 1:0 |
Suiza