| 1. Jornada | 02.08.1998 | SK Hradec Králové | - | Sigma Olomouc | 1:3 | ||||
| 2. Jornada | 08.08.1998 | Sigma Olomouc | - | Chmel Blsany | 2:1 | ||||
| 3. Jornada | 22.08.1998 | Viktoria Plzeň | - | Sigma Olomouc | 1:0 | ||||
| 4. Jornada | 30.08.1998 | Sigma Olomouc | - | FC Dukla Pribram | 0:0 | ||||
| 5. Jornada | 11.09.1998 | FC Karviná | - | Sigma Olomouc | 1:2 | ||||
| 6. Jornada | 19.09.1998 | Sigma Olomouc | - | Baník Ostrava | 3:2 | ||||
| 7. Jornada | 25.09.1998 | FC Petra Drnovice | - | Sigma Olomouc | 0:0 | ||||
| 8. Jornada | 05.10.1998 | Sigma Olomouc | - | FC Boby-sport Brno | 1:1 | ||||
| 18. Jornada | 07.03.1999 | Sigma Olomouc | - | Viktoria Plzeň | 1:1 | ||||
| 19. Jornada | 14.03.1999 | FC Dukla Pribram | - | Sigma Olomouc | 1:2 |  |
|||
| 20. Jornada | 20.03.1999 | Sigma Olomouc | - | FC Karviná | 2:0 | ||||
| 21. Jornada | 04.04.1999 | Baník Ostrava | - | Sigma Olomouc | 1:1 |  |
|||
| 22. Jornada | 11.04.1999 | Sigma Olomouc | - | FC Petra Drnovice | 0:1 | ||||
| 23. Jornada | 18.04.1999 | FC Boby-sport Brno | - | Sigma Olomouc | 0:0 | |
|||
| 24. Jornada | 25.04.1999 | Sigma Olomouc | - | SFC Opava | 3:1 | ||||
| 25. Jornada | 02.05.1999 | Viktoria Žižkov | - | Sigma Olomouc | 2:0 | |
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