| 15. Jornada | 04.11.2017 | VfR Aalen | - | FC Carl Zeiss Jena | 3:1 | ||||
| 31. Jornada | 24.03.2018 | Hansa Rostock | - | FC Carl Zeiss Jena | 0:0 | ||||
| 28. Jornada | 27.03.2018 | FC Carl Zeiss Jena | - | Würzburger Kickers | 1:2 | ||||
| 32. Jornada | 31.03.2018 | FC Carl Zeiss Jena | - | FSV Zwickau | 2:1 | ||||
| 27. Jornada | 04.04.2018 | SV Meppen | - | FC Carl Zeiss Jena | 2:1 | ||||
| 33. Jornada | 07.04.2018 | SC Paderborn 07 | - | FC Carl Zeiss Jena | 6:0 | ||||
| 34. Jornada | 14.04.2018 | FC Carl Zeiss Jena | - | VfR Aalen | 3:2 | ||||
| 30. Jornada | 17.04.2018 | FC Carl Zeiss Jena | - | 1. FC Magdeburg | 1:5 | ||||
| 35. Jornada | 21.04.2018 | Werder Bremen II | - | FC Carl Zeiss Jena | 2:4 |  |
|||
| 36. Jornada | 28.04.2018 | VfL Osnabrück | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:2 | ||||
| 37. Jornada | 05.05.2018 | FC Carl Zeiss Jena | - | SpVgg Unterhaching | 2:1 | ||||
| 38. Jornada | 12.05.2018 | Karlsruher SC | - | FC Carl Zeiss Jena | 2:3 |
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