| 1. Jornada | 30.07.2012 | Deportes Quindío | - | Atlético Junior | 0:0 | ||||
| 2. Jornada | 05.08.2012 | Atlético Junior | - | Real Cartagena | 1:0 |  |
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| 4. Jornada | 20.08.2012 | Deportivo Cali | - | Atlético Junior | 1:1 | ||||
| 8. Jornada | 17.09.2012 | Boyacá Chicó | - | Atlético Junior | 1:1 | ||||
| 10. Jornada | 27.09.2012 | Atlético Junior | - | Santa Fe | 1:1 | ||||
| 12. Jornada | 04.10.2012 | Atlético Junior | - | Atlético Huila | 4:0 | ||||
| 18. Jornada | 10.11.2012 | Atlético Junior | - | Once Caldas | 2:0 |
Colombia