| 2. Jornada | 08.02.2009 | Deportivo Cuenca | - | Macará | 0:1 |  |
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| 1. Jornada | 11.02.2009 | Espoli | - | Deportivo Cuenca | 1:0 |  |
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| 4. Jornada | 21.02.2009 | Deportivo Cuenca | - | Liga de Portoviejo | 3:0 | ||||
| 5. Jornada | 01.03.2009 | El Nacional | - | Deportivo Cuenca | 2:3 |  |
|||
| 8. Jornada | 22.03.2009 | Barcelona | - | Deportivo Cuenca | 2:1 | ||||
| 7. Jornada | 28.03.2009 | Deportivo Cuenca | - | Técnico Universitario | 3:2 | ||||
| 6. Jornada | 03.04.2009 | Deportivo Cuenca | - | LDU Quito | 1:0 | |
|||
| 15. Jornada | 17.05.2009 | Deportivo Cuenca | - | Barcelona | 1:0 | ||||
| 12. Jornada | 21.05.2009 | Deportivo Quito | - | Deportivo Cuenca | 2:0 | ||||
| 16. Jornada | 24.05.2009 | Técnico Universitario | - | Deportivo Cuenca | 2:1 | ||||
| 13. Jornada | 28.05.2009 | Deportivo Cuenca | - | Manta | 2:1 | ||||
| 17. Jornada | 31.05.2009 | LDU Quito | - | Deportivo Cuenca | 1:1 | ||||
| 18. Jornada | 14.06.2009 | Deportivo Cuenca | - | El Nacional | 1:0 | ||||
| 19. Jornada | 21.06.2009 | Liga de Portoviejo | - | Deportivo Cuenca | 2:2 | ||||
| 20. Jornada | 28.06.2009 | Deportivo Cuenca | - | Emelec | 0:1 | ||||
| 21. Jornada | 05.07.2009 | Macará | - | Deportivo Cuenca | 3:0 | ||||
| 22. Jornada | 12.07.2009 | Deportivo Cuenca | - | Espoli | 0:1 |  |
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