| Grupo B | 21.08.2016 | Universitario de Deportes | - | Alianza Atlético | 4:0 | ||||
| Grupo B | 29.08.2016 | Alianza Atlético | - | Sport Huancayo | 3:1 | ||||
| Grupo B | 11.09.2016 | Ayacucho FC | - | Alianza Atlético | 5:2 |  |
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| Grupo B | 18.09.2016 | Alianza Atlético | - | Universidad San Martín | 2:3 |  |
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| Grupo B | 25.09.2016 | Alianza Lima | - | Alianza Atlético | 0:0 | ||||
| Grupo B | 27.09.2016 | Universidad Técnica | - | Alianza Atlético | 4:0 | ||||
| Grupo B | 16.10.2016 | Alianza Atlético | - | Comerciantes Unidos | 1:0 |  |
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| Grupo B | 23.10.2016 | Sport Huancayo | - | Alianza Atlético | 3:1 | ||||
| Grupo B | 29.10.2016 | Alianza Atlético | - | Ayacucho FC | 1:1 | ||||
| Grupo B | 02.11.2016 | Universidad San Martín | - | Alianza Atlético | 3:1 |
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