| Primera etapa | 17.09.1998 | Rudar Velenje | - | NK Varteks | 0:1 | ||||
| Primera etapa | 01.10.1998 | NK Varteks | - | Rudar Velenje | 1:0 | ||||
| Segunda etapa | 05.11.1998 | NK Varteks | - | sc Heerenveen | 4:2 pró. | ||||
| Cuartos de final | 04.03.1999 | NK Varteks | - | Mallorca | 0:0 | ||||
| Cuartos de final | 18.03.1999 | Mallorca | - | NK Varteks | 3:1 |
Croacia