| 1. Jornada | 20.08.2016 | Elche | - | Rayo | 2:1 | ||||
| 2. Jornada | 28.08.2016 | Rayo | - | Valladolid | 0:0 | ||||
| 4. Jornada | 11.09.2016 | Rayo | - | Mallorca | 1:0 | ||||
| 8. Jornada | 02.10.2016 | Rayo | - | Cádiz CF | 3:0 | ||||
| 10. Jornada | 16.10.2016 | Rayo | - | Numancia | 3:3 |  |
|||
| 11. Jornada | 22.10.2016 | Rayo | - | Girona | 1:0 | ||||
| 12. Jornada | 29.10.2016 | Tenerife | - | Rayo | 3:2 | |
|||
| 13. Jornada | 05.11.2016 | Rayo | - | UCAM Murcia CF | 0:1 | ||||
| 15. Jornada | 20.11.2016 | Rayo | - | Huesca | 2:2 | ||||
| 21. Jornada | 14.01.2017 | Rayo | - | Sevilla Atlético | 1:1 | ||||
| 27. Jornada | 25.02.2017 | Getafe | - | Rayo | 1:0 | ||||
| 28. Jornada | 04.03.2017 | Rayo | - | CF Reus Deportiu | 0:0 | ||||
| 30. Jornada | 19.03.2017 | Rayo | - | Real Oviedo | 2:0 | ||||
| 31. Jornada | 25.03.2017 | Numancia | - | Rayo | 0:0 | ||||
| 35. Jornada | 22.04.2017 | Rayo | - | Lugo | 2:0 | |
|||
| 36. Jornada | 01.05.2017 | Huesca | - | Rayo | 2:0 | ||||
| 37. Jornada | 06.05.2017 | Rayo | - | Levante | 2:1 |  |
|||
| 38. Jornada | 13.05.2017 | Alcorcón | - | Rayo | 2:0 | ||||
| 39. Jornada | 19.05.2017 | Rayo | - | Gimnàstic de Tarragona | 2:0 | ||||
| 40. Jornada | 28.05.2017 | Zaragoza | - | Rayo | 1:1 | ||||
| 41. Jornada | 04.06.2017 | Rayo | - | Córdoba | 1:2 | ||||
| 42. Jornada | 09.06.2017 | Sevilla Atlético | - | Rayo | 1:2 |
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