| 3. Jornada | 12.08.2012 | MTK Budapest | - | Pécsi MFC | 0:0 |  |
|||
| 5. Jornada | 25.08.2012 | Kaposvári RFC | - | Pécsi MFC | 1:1 | ||||
| 6. Jornada | 31.08.2012 | Pécsi MFC | - | Kecskeméti TE | 0:1 | ||||
| 11. Jornada | 20.10.2012 | Pécsi MFC | - | Egri FC | 0:0 | ||||
| 14. Jornada | 09.11.2012 | Diósgyöri VTK | - | Pécsi MFC | 1:1 | ||||
| 16. Jornada | 23.11.2012 | Pécsi MFC | - | Paksi SE | 1:3 | ||||
| 17. Jornada | 02.12.2012 | Ferencvárosi TC | - | Pécsi MFC | 3:2 | ||||
| 19. Jornada | 10.03.2013 | Debreceni VSC | - | Pécsi MFC | 4:1 | ||||
| 21. Jornada | 30.03.2013 | Kecskeméti TE | - | Pécsi MFC | 0:2 | ||||
| 22. Jornada | 05.04.2013 | Pécsi MFC | - | Győri ETO FC | 0:2 | ||||
| 20. Jornada | 09.04.2013 | Pécsi MFC | - | Kaposvári RFC | 0:2 | ||||
| 25. Jornada | 28.04.2013 | Pécsi MFC | - | Budapest Honvéd | 0:3 | ||||
| 26. Jornada | 04.05.2013 | Egri FC | - | Pécsi MFC | 2:3 | ||||
| 27. Jornada | 11.05.2013 | Pécsi MFC | - | Szombathelyi Haladás | 0:2 | ||||
| 28. Jornada | 18.05.2013 | BFC Siófok | - | Pécsi MFC | 1:0 | ||||
| 29. Jornada | 27.05.2013 | Pécsi MFC | - | Diósgyöri VTK | 2:1 |  |
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| 30. Jornada | 01.06.2013 | Videoton FC | - | Pécsi MFC | 1:2 |
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