| 1. Jornada | 02.02.2020 | Academia Cantolao | - | Cienciano | 2:1 |  |
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| 2. Jornada | 09.02.2020 | Cienciano | - | Universidad San Martín | 4:0 |  |
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| 3. Jornada | 14.02.2020 | Cienciano | - | Llacuabamba | 5:2 | |
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| 4. Jornada | 25.02.2020 | Alianza Universidad | - | Cienciano | 1:0 | ||||
| 5. Jornada | 29.02.2020 | Cienciano | - | Ayacucho FC | 1:4 | ||||
| 6. Jornada | 07.03.2020 | Mannucci | - | Cienciano | 0:2 | ||||
| 9. Jornada | 31.08.2020 | Cienciano | - | Universitario de Deportes | 1:3 | ||||
| 10. Jornada | 08.09.2020 | Deportivo Binacional | - | Cienciano | 0:0 | |
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| 11. Jornada | 15.09.2020 | Cienciano | - | Sporting Cristal | 0:0 | ||||
| 12. Jornada | 19.09.2020 | Cusco FC | - | Cienciano | 2:3 | |
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| 14. Jornada | 26.09.2020 | Universidad Técnica | - | Cienciano | 3:0 | ||||
| 15. Jornada | 29.09.2020 | Cienciano | - | Sport Huancayo | 0:0 | ||||
| 16. Jornada | 02.10.2020 | César Vallejo | - | Cienciano | 1:0 | ||||
| 17. Jornada | 08.10.2020 | Cienciano | - | Carlos Stein | 0:1 | |
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| 18. Jornada | 14.10.2020 | Sport Boys | - | Cienciano | 2:1 | |
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| 19. Jornada | 17.10.2020 | Cienciano | - | Alianza Lima | 2:1 |
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