| 7. Jornada | 15.03.2009 | América de Cali | - | Boyacá Chicó | 1:1 | ||||
| 8. Jornada | 20.03.2009 | Boyacá Chicó | - | Atlético Junior | 0:0 | ||||
| 10. Jornada | 04.04.2009 | Deportes Quindío | - | Boyacá Chicó | 2:0 | ||||
| 11. Jornada | 12.04.2009 | Boyacá Chicó | - | Deportes Tolima | 1:1 |  |
|||
| 12. Jornada | 20.04.2009 | Millonarios | - | Boyacá Chicó | 0:1 | ||||
| 14. Jornada | 23.04.2009 | Atlético Nacional | - | Boyacá Chicó | 2:1 | ||||
| 13. Jornada | 25.04.2009 | Boyacá Chicó | - | Cúcuta Deportivo | 4:0 | ||||
| 15. Jornada | 03.05.2009 | Boyacá Chicó | - | Once Caldas | 1:0 | ||||
| 16. Jornada | 10.05.2009 | Deportivo Pasto | - | Boyacá Chicó | 0:1 |
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