| 1. Jornada | 02.02.2013 | Patriotas FC | - | Boyacá Chicó | 1:1 |  |
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| 2. Jornada | 09.02.2013 | Boyacá Chicó | - | Deportivo Cali | 1:2 | ||||
| 3. Jornada | 16.02.2013 | Atlético Junior | - | Boyacá Chicó | 2:2 | |
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| 7. Jornada | 17.03.2013 | Independiente Medellín | - | Boyacá Chicó | 3:1 | ||||
| 9. Jornada | 06.04.2013 | Boyacá Chicó | - | Patriotas FC | 0:0 | ||||
| 10. Jornada | 14.04.2013 | Once Caldas | - | Boyacá Chicó | 2:2 | ||||
| 11. Jornada | 17.04.2013 | Alianza Petrolera | - | Boyacá Chicó | 3:1 | ||||
| 13. Jornada | 28.04.2013 | Cúcuta Deportivo | - | Boyacá Chicó | 0:1 | ||||
| 14. Jornada | 05.05.2013 | Boyacá Chicó | - | Atlético Huila | 2:1 | ||||
| 15. Jornada | 12.05.2013 | Santa Fe | - | Boyacá Chicó | 4:3 |  |
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| 16. Jornada | 19.05.2013 | Boyacá Chicó | - | Atlético Nacional | 2:3 | |
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| 17. Jornada | 25.05.2013 | Itagüi Ditaires | - | Boyacá Chicó | 3:0 | ||||
| 18. Jornada | 01.06.2013 | Boyacá Chicó | - | Deportes Quindío | 1:1 |
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