| 1. Jornada | 28.07.2012 | 1. FC Slovácko | - | Zbrojovka Brno | 0:1 |  |
|||
| 2. Jornada | 05.08.2012 | Sigma Olomouc | - | 1. FC Slovácko | 2:0 | |
|||
| 3. Jornada | 12.08.2012 | 1. FC Slovácko | - | Sparta Praga | 1:4 | |
|||
| 4. Jornada | 17.08.2012 | FK Dukla Praha | - | 1. FC Slovácko | 2:2 | ||||
| 5. Jornada | 25.08.2012 | 1. FC Slovácko | - | FK Teplice | 2:1 | ||||
| 6. Jornada | 01.09.2012 | 1. FK Příbram | - | 1. FC Slovácko | 0:1 | ||||
| 7. Jornada | 15.09.2012 | 1. FC Slovácko | - | FK Mladá Boleslav | 3:1 | ||||
| 8. Jornada | 22.09.2012 | 1. FC Slovácko | - | FK Baumit Jablonec | 0:1 | |
|||
| 22. Jornada | 07.04.2013 | FK Baumit Jablonec | - | 1. FC Slovácko | 4:1 | ||||
| 23. Jornada | 14.04.2013 | 1. FC Slovácko | - | Viktoria Plzeň | 0:2 | |
|||
| 24. Jornada | 22.04.2013 | Slavia Praga | - | 1. FC Slovácko | 1:0 | ||||
| 25. Jornada | 27.04.2013 | 1. FC Slovácko | - | Dynamo České Budějovice | 2:0 | |
|||
| 26. Jornada | 05.05.2013 | FC Hradec Králové | - | 1. FC Slovácko | 2:3 | |
|||
| 27. Jornada | 11.05.2013 | 1. FC Slovácko | - | Slovan Liberec | 0:3 | |
República Checa