| 1. Jornada | 08.08.2008 | FC Zwolle | - | MVV | 0:0 | ||||
| 2. Jornada | 15.08.2008 | RBC Roosendaal | - | FC Zwolle | 1:3 |  |
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| 3. Jornada | 22.08.2008 | FC Zwolle | - | SC Cambuur | 3:1 |  |
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| 10. Jornada | 05.10.2008 | FC Zwolle | - | Go Ahead Eagles | 1:0 | ||||
| 12. Jornada | 17.10.2008 | AGOVV | - | FC Zwolle | 2:1 | ||||
| 13. Jornada | 24.10.2008 | FC Zwolle | - | RKC Waalwijk | 1:1 | |
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| 15. Jornada | 07.11.2008 | FC Zwolle | - | Helmond Sport | 0:1 | ||||
| 16. Jornada | 15.11.2008 | Fortuna Sittard | - | FC Zwolle | 1:3 | |
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| 17. Jornada | 21.11.2008 | FC Omniworld | - | FC Zwolle | 3:3 | |
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| 18. Jornada | 28.11.2008 | FC Zwolle | - | SBV Excelsior | 1:1 | ||||
| 19. Jornada | 05.12.2008 | FC Den Bosch | - | FC Zwolle | 3:4 | ||||
| 20. Jornada | 12.12.2008 | MVV | - | FC Zwolle | 4:1 | ||||
| 21. Jornada | 19.12.2008 | FC Zwolle | - | FC Dordrecht | 2:1 | ||||
| 22. Jornada | 18.01.2009 | Go Ahead Eagles | - | FC Zwolle | 0:1 |
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