| 1. Jornada | 01.08.1999 | FC Boby-sport Brno | - | Sigma Olomouc | 1:0 |  |
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| 5. Jornada | 29.08.1999 | Slovan Liberec | - | Sigma Olomouc | 0:0 | ||||
| 6. Jornada | 12.09.1999 | Sigma Olomouc | - | Chmel Blsany | 0:1 | ||||
| 17. Jornada | 19.02.2000 | CU Bohemians Praha | - | Sigma Olomouc | 1:3 |  |
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| 18. Jornada | 27.02.2000 | Sigma Olomouc | - | Baník Ostrava | 4:1 | |
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| 19. Jornada | 05.03.2000 | SK Hradec Králové | - | Sigma Olomouc | 0:0 | ||||
| 20. Jornada | 12.03.2000 | Sigma Olomouc | - | Slovan Liberec | 1:1 | ||||
| 21. Jornada | 19.03.2000 | Chmel Blsany | - | Sigma Olomouc | 1:0 | ||||
| 22. Jornada | 26.03.2000 | Sigma Olomouc | - | Slavia Praga | 0:2 | ||||
| 23. Jornada | 02.04.2000 | Sigma Olomouc | - | FC Dukla Pribram | 1:0 | ||||
| 25. Jornada | 16.04.2000 | Sigma Olomouc | - | Viktoria Žižkov | 2:0 | |
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| 26. Jornada | 22.04.2000 | SFC Opava | - | Sigma Olomouc | 3:0 | ||||
| 27. Jornada | 30.04.2000 | Sigma Olomouc | - | FK Jablonec 97 | 0:0 | ||||
| 28. Jornada | 07.05.2000 | FK Teplice | - | Sigma Olomouc | 2:1 | ||||
| 29. Jornada | 13.05.2000 | Sigma Olomouc | - | Sparta Praga | 1:1 |
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