| Grupo A | 26.08.2012 | Sport Huancayo | - | Cienciano | 2:0 | ||||
| Grupo A | 02.09.2012 | Cienciano | - | Cobresol FBC | 2:0 | ||||
| Grupo A | 16.09.2012 | Universidad San Martín | - | Cienciano | 1:0 |  |
|||
| Grupo A | 22.09.2012 | Cienciano | - | Inti Gas | 0:0 | ||||
| Grupo A | 30.09.2012 | José Gálvez | - | Cienciano | 0:3 | ||||
| Grupo A | 10.11.2012 | Inti Gas | - | Cienciano | 0:1 | ||||
| Grupo A | 18.11.2012 | Cienciano | - | José Gálvez | 2:0 | ||||
| Grupo A | 25.11.2012 | Sporting Cristal | - | Cienciano | 3:3 |
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