| 21. Jornada | 05.08.2018 | FC Kuressaare | - | FC Flora | 0:4 |  |
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| 22. Jornada | 10.08.2018 | Paide Linnameeskond | - | FC Flora | 3:3 | ||||
| 23. Jornada | 19.08.2018 | FC Flora | - | JK Tallinna Kalev | 3:1 | |
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| 24. Jornada | 24.08.2018 | FC Flora | - | JK Tammeka | 5:0 | ||||
| 25. Jornada | 29.08.2018 | FC Flora | - | FCI Levadia | 3:0 |  |
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| 26. Jornada | 02.09.2018 | JK Nõmme Kalju | - | FC Flora | 1:1 | ||||
| 27. Jornada | 15.09.2018 | FC Flora | - | JK Narva Trans | 2:2 | ||||
| 28. Jornada | 19.09.2018 | FC Flora | - | Paide Linnameeskond | 7:2 | |
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| 29. Jornada | 22.09.2018 | FC Flora | - | Pärnu JK Vaprus | 3:0 | |
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| 30. Jornada | 30.09.2018 | JK Tallinna Kalev | - | FC Flora | 2:2 | ||||
| 31. Jornada | 03.10.2018 | JK Tammeka | - | FC Flora | 0:4 | |
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| 32. Jornada | 07.10.2018 | FC Flora | - | JK Nõmme Kalju | 2:2 | |
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| 34. Jornada | 27.10.2018 | FC Flora | - | FC Kuressaare | 4:0 | |
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| 35. Jornada | 03.11.2018 | Tulevik Viljandi | - | FC Flora | 1:3 | ||||
| 36. Jornada | 10.11.2018 | FCI Levadia | - | FC Flora | 2:1 | |
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