| 2. Jornada | 13.02.2016 | Deportivo Cuenca | - | El Nacional | 0:0 | ||||
| 4. Jornada | 21.02.2016 | El Nacional | - | Delfín SC | 2:0 | ||||
| 5. Jornada | 01.03.2016 | Emelec | - | El Nacional | 0:1 | ||||
| 3. Jornada | 10.03.2016 | Independiente del Valle | - | El Nacional | 1:0 |  |
|||
| 7. Jornada | 13.03.2016 | Fuerza Amarilla | - | El Nacional | 2:0 | ||||
| 8. Jornada | 19.03.2016 | El Nacional | - | Universidad Catolica | 2:2 | ||||
| 9. Jornada | 27.03.2016 | Aucas | - | El Nacional | 0:0 | ||||
| 10. Jornada | 02.04.2016 | El Nacional | - | LDU Quito | 1:1 | ||||
| 11. Jornada | 09.04.2016 | Mushuc Runa | - | El Nacional | 0:2 | ||||
| 12. Jornada | 16.04.2016 | El Nacional | - | Mushuc Runa | 0:1 | ||||
| 13. Jornada | 05.05.2016 | LDU Quito | - | El Nacional | 1:2 | ||||
| 17. Jornada | 25.06.2016 | Club Deportivo River Plate Ecuador | - | El Nacional | 4:2 |  |
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