| 13. Jornada | 20.10.2012 | FK Senica | - | 1. FC Tatran Prešov | 2:0 | ||||
| 15. Jornada | 03.11.2012 | FK Senica | - | MŠK Žilina | 0:0 | ||||
| 16. Jornada | 10.11.2012 | Spartak Trnava | - | FK Senica | 1:1 | ||||
| 17. Jornada | 17.11.2012 | FK Senica | - | Slovan Bratislava | 0:1 | ||||
| 19. Jornada | 02.12.2012 | AS Trenčín | - | FK Senica | 1:1 | ||||
| 20. Jornada | 03.03.2013 | FK Senica | - | MFK Ružomberok | 0:3 | ||||
| 21. Jornada | 08.03.2013 | Zlaté Moravce | - | FK Senica | 0:2 | ||||
| 25. Jornada | 06.04.2013 | FK Senica | - | MFK Košice | 0:0 | ||||
| 26. Jornada | 13.04.2013 | MŠK Žilina | - | FK Senica | 0:1 |  |
|||
| 29. Jornada | 04.05.2013 | FK Senica | - | Spartak Myjava | 0:3 |
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