| 20. Jornada | 26.02.2016 | MFK Skalica | - | MŠK Žilina | 1:0 |  |
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| 21. Jornada | 02.03.2016 | FC DAC 1904 | - | MFK Skalica | 1:0 | ||||
| 22. Jornada | 05.03.2016 | MFK Skalica | - | AS Trenčín | 1:2 | ||||
| 23. Jornada | 12.03.2016 | MFK Ružomberok | - | MFK Skalica | 3:1 | ||||
| 24. Jornada | 20.03.2016 | MFK Skalica | - | MFK Zemplín Michalovce | 0:0 | ||||
| 25. Jornada | 02.04.2016 | FK Senica | - | MFK Skalica | 2:2 | |
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| 26. Jornada | 09.04.2016 | MFK Skalica | - | FO ŽP Šport Podbrezová | 2:1 | ||||
| 27. Jornada | 16.04.2016 | Spartak Trnava | - | MFK Skalica | 5:1 | ||||
| 28. Jornada | 19.04.2016 | MFK Skalica | - | Zlaté Moravce | 1:0 | ||||
| 30. Jornada | 01.05.2016 | MFK Skalica | - | Spartak Myjava | 1:2 | ||||
| 31. Jornada | 06.05.2016 | MŠK Žilina | - | MFK Skalica | 1:0 | ||||
| 32. Jornada | 13.05.2016 | MFK Skalica | - | FC DAC 1904 | 2:1 | ||||
| 33. Jornada | 20.05.2016 | AS Trenčín | - | MFK Skalica | 2:1 |
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