| 19. Jornada | 14.07.2012 | JK Sillamäe Kalev | - | FC Viljandi | 2:2 |  |
|||
| 4. Jornada | 17.07.2012 | FC Viljandi | - | JK Tammeka | 3:2 | |
|||
| 25. Jornada | 25.08.2012 | Paide Linnameeskond | - | FC Viljandi | 0:2 | |
|||
| 35. Jornada | 27.10.2012 | FC Kuressaare | - | FC Viljandi | 3:3 | |
Estonia