| 14. Jornada | 09.11.2008 | Hajduk Split | - | NK Zagreb | 4:0 |  |
|||
| 16. Jornada | 23.11.2008 | NK Osijek | - | NK Zagreb | 0:2 | |
|||
| 17. Jornada | 30.11.2008 | NK Zagreb | - | HNK Šibenik | 0:4 | |
|||
| 19. Jornada | 22.02.2009 | NK Zagreb | - | NK Inter Zaprešić | 0:1 | ||||
| 22. Jornada | 15.03.2009 | NK Zadar | - | NK Zagreb | 2:1 | |
|||
| 30. Jornada | 10.05.2009 | Slaven Belupo | - | NK Zagreb | 2:1 | |
|||
| 31. Jornada | 17.05.2009 | NK Zagreb | - | NK Croatia Sesvete | 0:0 | ||||
| 32. Jornada | 24.05.2009 | Dinamo Zagreb | - | NK Zagreb | 0:1 | |
Bosnia y Herzegovina