| 1. Jornada | 31.01.2016 | Atlético Bucaramanga | - | Independiente Medellín | 2:2 | ||||
| 2. Jornada | 06.02.2016 | Independiente Medellín | - | Atlético Junior | 0:1 | ||||
| 3. Jornada | 14.02.2016 | Envigado FC | - | Independiente Medellín | 0:1 |  |
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| 4. Jornada | 18.02.2016 | Independiente Medellín | - | Cortuluá | 2:0 | |
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| 5. Jornada | 20.02.2016 | La Equidad | - | Independiente Medellín | 2:2 | ||||
| 6. Jornada | 24.02.2016 | Atlético Huila | - | Independiente Medellín | 0:3 | |
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| 7. Jornada | 28.02.2016 | Independiente Medellín | - | Deportivo Cali | 1:1 | ||||
| 8. Jornada | 07.03.2016 | Patriotas FC | - | Independiente Medellín | 0:0 | ||||
| 9. Jornada | 12.03.2016 | Independiente Medellín | - | Santa Fe | 2:1 | |
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| 10. Jornada | 20.03.2016 | Independiente Medellín | - | Atlético Nacional | 1:1 | |
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| 11. Jornada | 02.04.2016 | Deportivo Pasto | - | Independiente Medellín | 1:0 | |
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| 12. Jornada | 09.04.2016 | Independiente Medellín | - | Alianza Petrolera | 4:2 | |
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| 18. Jornada | 15.05.2016 | Independiente Medellín | - | Once Caldas | 2:1 | ||||
| 19. Jornada | 22.05.2016 | Boyacá Chicó | - | Independiente Medellín | 1:1 |
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