| 1. Jornada | 31.08.2008 | AE Lárissa | - | Thrasyvoulos Fylis | 3:0 | ||||
| 2. Jornada | 14.09.2008 | Levadiakos | - | Thrasyvoulos Fylis | 1:0 | ||||
| 3. Jornada | 21.09.2008 | Thrasyvoulos Fylis | - | Asteras Tripolis | 0:2 | ||||
| 4. Jornada | 28.09.2008 | Skoda Xanthi | - | Thrasyvoulos Fylis | 1:0 | ||||
| 5. Jornada | 05.10.2008 | Thrasyvoulos Fylis | - | Panserraikos | 0:1 | ||||
| 8. Jornada | 02.11.2008 | Panthrakikos | - | Thrasyvoulos Fylis | 1:0 | ||||
| 9. Jornada | 09.11.2008 | Thrasyvoulos Fylis | - | Aris Saloniki | 1:2 | ||||
| 10. Jornada | 16.11.2008 | Ergotelis | - | Thrasyvoulos Fylis | 1:2 |  |
|||
| 11. Jornada | 22.11.2008 | Panathinaikos | - | Thrasyvoulos Fylis | 3:0 | |
|||
| 28. Jornada | 05.04.2009 | Thrasyvoulos Fylis | - | Iraklis Saloniki | 1:1 | ||||
| 29. Jornada | 12.04.2009 | Panionios GSS | - | Thrasyvoulos Fylis | 4:1 | |
|||
| 30. Jornada | 26.04.2009 | Thrasyvoulos Fylis | - | Olympiacos | 0:2 |
Grecia