| 1. Jornada | 23.08.1998 | Apollon Smyrnis | - | Olympiacos | 2:5 | ||||
| 2. Jornada | 30.08.1998 | AEK Athen | - | Apollon Smyrnis | 3:1 |  |
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| 3. Jornada | 13.09.1998 | Panionios GSS | - | Apollon Smyrnis | 4:2 | ||||
| 4. Jornada | 20.09.1998 | Apollon Smyrnis | - | Panelefsiniakos Elefsinas | 1:1 | ||||
| 5. Jornada | 27.09.1998 | Veria FC | - | Apollon Smyrnis | 1:1 |  |
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| 6. Jornada | 04.10.1998 | Apollon Smyrnis | - | OFI Heraklion | 1:0 | ||||
| 7. Jornada | 25.10.1998 | Paniliakos Pyrgos | - | Apollon Smyrnis | 3:1 | ||||
| 8. Jornada | 01.11.1998 | Apollon Smyrnis | - | AO Proodeftiki | 2:2 | ||||
| 9. Jornada | 08.11.1998 | Ethnikos Asteras | - | Apollon Smyrnis | 5:1 | ||||
| 10. Jornada | 22.11.1998 | Apollon Smyrnis | - | PAOK Saloniki | 1:4 | ||||
| 11. Jornada | 29.11.1998 | Ionikos Nikea | - | Apollon Smyrnis | 3:0 | ||||
| 12. Jornada | 06.12.1998 | Apollon Smyrnis | - | Aris Saloniki | 1:3 | ||||
| 13. Jornada | 13.12.1998 | Apollon Smyrnis | - | AO Kavala | 1:1 | |
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| 14. Jornada | 20.12.1998 | Panathinaikos | - | Apollon Smyrnis | 5:0 |
Grecia