| 5. Jornada | 25.09.2016 | PAOK Saloniki | - | Xanthi FC | 0:0 |  |
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| 6. Jornada | 03.10.2016 | Xanthi FC | - | Atromitos | 0:0 | ||||
| 7. Jornada | 16.10.2016 | Panathinaikos | - | Xanthi FC | 1:2 | |
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| 10. Jornada | 05.11.2016 | Levadiakos | - | Xanthi FC | 1:1 | |
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| 12. Jornada | 27.11.2016 | Panetolikos | - | Xanthi FC | 2:3 | ||||
| 13. Jornada | 04.12.2016 | Xanthi FC | - | Asteras Tripolis | 3:1 | ||||
| 14. Jornada | 10.12.2016 | Xanthi FC | - | AE Lárissa | 1:0 | ||||
| 1. Jornada | 03.01.2017 | AEP Iraklis FC | - | Xanthi FC | 0:1 | ||||
| 2. Jornada | 08.01.2017 | Xanthi FC | - | Olympiacos | 0:2 | ||||
| 11. Jornada | 15.01.2017 | Xanthi FC | - | PAS Giannina | 2:0 |
Grecia