| 13. Jornada | 04.12.2016 | Panathinaikos | - | PAOK Saloniki | 1:0 | ||||
| 14. Jornada | 11.12.2016 | Atromitos | - | Panathinaikos | 0:1 | ||||
| 15. Jornada | 18.12.2016 | AE Lárissa | - | Panathinaikos | 0:0 |  |
|||
| 1. Jornada | 05.01.2017 | Platanias Chanion | - | Panathinaikos | 1:0 | ||||
| 2. Jornada | 09.01.2017 | Panathinaikos | - | AO Kerkyra | 1:0 | ||||
| 11. Jornada | 15.01.2017 | Panathinaikos | - | AEK Athen | 0:0 | ||||
| 16. Jornada | 19.01.2017 | Panathinaikos | - | Platanias Chanion | 2:1 | ||||
| 18. Jornada | 29.01.2017 | Panathinaikos | - | Levadiakos | 0:0 | ||||
| 21. Jornada | 18.02.2017 | Asteras Tripolis | - | Panathinaikos | 0:5 |  |
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| 22. Jornada | 25.02.2017 | Xanthi FC | - | Panathinaikos | 1:0 | ||||
| 24. Jornada | 11.03.2017 | AEP Iraklis FC | - | Panathinaikos | 1:1 | ||||
| 25. Jornada | 19.03.2017 | Panathinaikos | - | Olympiacos | 1:0 | ||||
| 26. Jornada | 02.04.2017 | AEK Athen | - | Panathinaikos | 2:3 | ||||
| 28. Jornada | 09.04.2017 | PAOK Saloniki | - | Panathinaikos | 3:0 | |
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| 29. Jornada | 23.04.2017 | Panathinaikos | - | Atromitos | 1:0 |
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