| 1. Jornada | 18.01.2004 | Atlas Guadalajara | - | Puebla FC | 1:1 | ||||
| 2. Jornada | 25.01.2004 | Pumas UNAM | - | Atlas Guadalajara | 3:0 |  |
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| 3. Jornada | 01.02.2004 | Atlas Guadalajara | - | Cruz Azul | 0:2 | ||||
| 4. Jornada | 07.02.2004 | Veracruz (old) | - | Atlas Guadalajara | 1:1 | ||||
| 5. Jornada | 15.02.2004 | Atlas Guadalajara | - | UAG Tecos | 3:2 | ||||
| 6. Jornada | 22.02.2004 | CF Monterrey | - | Atlas Guadalajara | 1:1 | |
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| 7. Jornada | 27.02.2004 | Atlas Guadalajara | - | CF América | 3:1 | ||||
| 8. Jornada | 29.02.2004 | Club Irapuato | - | Atlas Guadalajara | 2:1 | ||||
| 16. Jornada | 25.04.2004 | Atlas Guadalajara | - | UANL Tigres | 2:2 | ||||
| 17. Jornada | 01.05.2004 | Deportivo Toluca | - | Atlas Guadalajara | 2:2 | |
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| 18. Jornada | 09.05.2004 | Atlas Guadalajara | - | Deportivo Guadalajara | 1:1 | ||||
| 19. Jornada | 16.05.2004 | Club Necaxa | - | Atlas Guadalajara | 0:1 |
México