| 14. Jornada | 18.11.2016 | Vysočina Jihlava | - | FC Fastav Zlín | 1:3 |  |
|||
| 27. Jornada | 07.05.2017 | Zbrojovka Brno | - | FC Fastav Zlín | 2:0 | ||||
| 28. Jornada | 13.05.2017 | FC Fastav Zlín | - | Vysočina Jihlava | 0:3 | ||||
| 29. Jornada | 20.05.2017 | FK Dukla Praha | - | FC Fastav Zlín | 1:0 | ||||
| 30. Jornada | 27.05.2017 | 1. FK Příbram | - | FC Fastav Zlín | 0:2 |
República Checa