| 1. Jornada | 30.08.2008 | OFI Heraklion | - | PAOK Saloniki | 0:2 | ||||
| 3. Jornada | 20.09.2008 | Panthrakikos | - | PAOK Saloniki | 0:1 | ||||
| 4. Jornada | 28.09.2008 | PAOK Saloniki | - | Aris Saloniki | 1:0 | ||||
| 5. Jornada | 04.10.2008 | Ergotelis | - | PAOK Saloniki | 0:0 | ||||
| 6. Jornada | 19.10.2008 | PAOK Saloniki | - | Panathinaikos | 0:0 | ||||
| 7. Jornada | 25.10.2008 | PAOK Saloniki | - | Levadiakos | 3:1 | ||||
| 8. Jornada | 02.11.2008 | Iraklis Saloniki | - | PAOK Saloniki | 1:1 |  |
|||
| 11. Jornada | 23.11.2008 | PAOK Saloniki | - | AE Lárissa | 1:0 | ||||
| 13. Jornada | 07.12.2008 | PAOK Saloniki | - | Asteras Tripolis | 1:1 | ||||
| 14. Jornada | 13.12.2008 | PAOK Saloniki | - | Skoda Xanthi | 1:0 | ||||
| 15. Jornada | 20.12.2008 | Panserraikos | - | PAOK Saloniki | 1:1 | ||||
| 16. Jornada | 04.01.2009 | PAOK Saloniki | - | OFI Heraklion | 2:0 | ||||
| 17. Jornada | 11.01.2009 | AEK Athen | - | PAOK Saloniki | 1:0 | ||||
| 20. Jornada | 01.02.2009 | PAOK Saloniki | - | Ergotelis | 2:0 | ||||
| 24. Jornada | 01.03.2009 | Panionios GSS | - | PAOK Saloniki | 1:2 | ||||
| 26. Jornada | 14.03.2009 | AE Lárissa | - | PAOK Saloniki | 0:0 |
Grecia