| 1. Jornada | 16.08.2008 | SC Verl | - | Bayer Leverkusen II | 2:2 | ||||
| 2. Jornada | 22.08.2008 | Bayer Leverkusen II | - | SV 07 Elversberg | 1:0 | ||||
| 3. Jornada | 29.08.2008 | FSV Oggersheim | - | Bayer Leverkusen II | 3:0 | ||||
| 10. Jornada | 28.10.2008 | Bayer Leverkusen II | - | Eintracht Trier | 2:1 | ||||
| 11. Jornada | 01.11.2008 | BV Cloppenburg | - | Bayer Leverkusen II | 0:1 | ||||
| 12. Jornada | 08.11.2008 | Bayer Leverkusen II | - | Wormatia Worms | 0:3 | ||||
| 15. Jornada | 29.11.2008 | Mainz II | - | Bayer Leverkusen II | 1:1 | ||||
| 14. Jornada | 02.12.2008 | Bayer Leverkusen II | - | Rot-Weiss Essen | 4:2 | ||||
| 20. Jornada | 28.02.2009 | Bayer Leverkusen II | - | FSV Oggersheim | 3:2 |  |
|||
| 24. Jornada | 27.03.2009 | Bayer Leverkusen II | - | 1. FC Kaiserslautern II | 5:1 | ||||
| 31. Jornada | 15.05.2009 | Rot-Weiss Essen | - | Bayer Leverkusen II | 3:0 | ||||
| 32. Jornada | 22.05.2009 | Bayer Leverkusen II | - | Mainz II | 2:2 | ||||
| 33. Jornada | 30.05.2009 | 1. FC Kleve | - | Bayer Leverkusen II | 1:4 | ||||
| 34. Jornada | 06.06.2009 | Bayer Leverkusen II | - | Bor. Mönchengladbach II | 1:3 |
Polonia