| 16. Jornada | 22.02.1999 | Sigma Olomouc | - | SK Hradec Králové | 1:0 |  |
 |
||
| 17. Jornada | 28.02.1999 | Chmel Blsany | - | Sigma Olomouc | 3:2 | |
|
||
| 18. Jornada | 07.03.1999 | Sigma Olomouc | - | Viktoria Plzeň | 1:1 | ||||
| 19. Jornada | 14.03.1999 | FC Dukla Pribram | - | Sigma Olomouc | 1:2 | |
|||
| 20. Jornada | 20.03.1999 | Sigma Olomouc | - | FC Karviná | 2:0 | ||||
| 21. Jornada | 04.04.1999 | Baník Ostrava | - | Sigma Olomouc | 1:1 | |
|||
| 22. Jornada | 11.04.1999 | Sigma Olomouc | - | FC Petra Drnovice | 0:1 | ||||
| 23. Jornada | 18.04.1999 | FC Boby-sport Brno | - | Sigma Olomouc | 0:0 | ||||
| 26. Jornada | 09.05.1999 | Sigma Olomouc | - | Slovan Liberec | 3:0 | |
|||
| 27. Jornada | 12.05.1999 | FK Jablonec 97 | - | Sigma Olomouc | 3:2 | |
|||
| 28. Jornada | 17.05.1999 | Sigma Olomouc | - | Slavia Praga | 1:1 | |
 |
||
| 29. Jornada | 24.05.1999 | Sparta Praga | - | Sigma Olomouc | 2:2 | |
República Checa