| 1. Jornada | 14.07.2012 | Spartak Trnava | - | MFK Košice | 0:0 | ||||
| 2. Jornada | 22.07.2012 | MFK Košice | - | Slovan Bratislava | 1:0 |  |
|||
| 3. Jornada | 29.07.2012 | FK Senica | - | MFK Košice | 2:1 | ||||
| 4. Jornada | 04.08.2012 | MFK Košice | - | AS Trenčín | 3:0 | ||||
| 5. Jornada | 11.08.2012 | MFK Ružomberok | - | MFK Košice | 3:1 | |
|||
| 7. Jornada | 25.08.2012 | FC Nitra | - | MFK Košice | 4:1 | ||||
| 8. Jornada | 01.09.2012 | MFK Košice | - | FK Dukla Banská Bystrica | 1:0 | ||||
| 9. Jornada | 15.09.2012 | 1. FC Tatran Prešov | - | MFK Košice | 0:0 | ||||
| 12. Jornada | 05.10.2012 | MFK Košice | - | Spartak Trnava | 1:0 | ||||
| 13. Jornada | 21.10.2012 | Slovan Bratislava | - | MFK Košice | 3:1 | ||||
| 17. Jornada | 16.11.2012 | Zlaté Moravce | - | MFK Košice | 1:0 | ||||
| 21. Jornada | 09.03.2013 | MFK Košice | - | Spartak Myjava | 1:2 | ||||
| 27. Jornada | 20.04.2013 | MFK Ružomberok | - | MFK Košice | 1:1 | ||||
| 28. Jornada | 27.04.2013 | MFK Košice | - | Zlaté Moravce | 0:2 | ||||
| 30. Jornada | 11.05.2013 | MFK Košice | - | FK Dukla Banská Bystrica | 1:0 | ||||
| 29. Jornada | 14.05.2013 | FC Nitra | - | MFK Košice | 1:0 | ||||
| 31. Jornada | 18.05.2013 | 1. FC Tatran Prešov | - | MFK Košice | 0:0 | ||||
| 33. Jornada | 26.05.2013 | MFK Košice | - | MŠK Žilina | 2:2 |
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