| 16. Jornada | 28.01.2001 | Panionios GSS | - | Paniliakos Pyrgos | 0:1 |  |
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| 17. Jornada | 04.02.2001 | Panathinaikos | - | Panionios GSS | 0:1 | ||||
| 18. Jornada | 12.02.2001 | Panionios GSS | - | PAOK Saloniki | 1:1 | ||||
| 19. Jornada | 18.02.2001 | Skoda Xanthi | - | Panionios GSS | 3:1 | |
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| 20. Jornada | 25.02.2001 | Iraklis Saloniki | - | Panionios GSS | 4:3 | |
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| 23. Jornada | 18.03.2001 | Panionios GSS | - | Ionikos Nikea | 4:0 | ||||
| 24. Jornada | 01.04.2001 | AEK Athen | - | Panionios GSS | 5:1 | |
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| 25. Jornada | 08.04.2001 | Panionios GSS | - | Panachaiki GE | 2:0 | ||||
| 26. Jornada | 20.04.2001 | PS Kalamata | - | Panionios GSS | 2:1 | |
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| 27. Jornada | 29.04.2001 | Panionios GSS | - | PAS Giannina | 4:0 | ||||
| 28. Jornada | 06.05.2001 | Panionios GSS | - | Olympiacos | 2:1 | |
Eslovaquia