| 9. Jornada | 08.11.1998 | Skoda Xanthi | - | Aris Saloniki | 2:0 | ||||
| 11. Jornada | 29.11.1998 | Skoda Xanthi | - | Panathinaikos | 1:0 | ||||
| 13. Jornada | 12.12.1998 | Skoda Xanthi | - | Iraklis Saloniki | 0:0 | ||||
| 15. Jornada | 16.01.1999 | Olympiacos | - | Skoda Xanthi | 3:1 | ||||
| 16. Jornada | 23.01.1999 | Skoda Xanthi | - | AEK Athen | 2:1 | ||||
| 17. Jornada | 30.01.1999 | Apollon Smyrnis | - | Skoda Xanthi | 2:1 | ||||
| 18. Jornada | 07.02.1999 | Skoda Xanthi | - | Panelefsiniakos Elefsinas | 0:0 | ||||
| 20. Jornada | 21.02.1999 | Skoda Xanthi | - | OFI Heraklion | 3:1 |  |
|||
| 21. Jornada | 28.02.1999 | Paniliakos Pyrgos | - | Skoda Xanthi | 1:0 | ||||
| 23. Jornada | 14.03.1999 | Skoda Xanthi | - | Ethnikos Asteras | 0:1 |  |
|||
| 26. Jornada | 18.04.1999 | Aris Saloniki | - | Skoda Xanthi | 1:2 | ||||
| 28. Jornada | 02.05.1999 | Panathinaikos | - | Skoda Xanthi | 2:1 | |
|||
| 30. Jornada | 12.05.1999 | Iraklis Saloniki | - | Skoda Xanthi | 2:2 | |
|||
| 31. Jornada | 16.05.1999 | Panionios GSS | - | Skoda Xanthi | 0:2 | ||||
| 32. Jornada | 19.05.1999 | Skoda Xanthi | - | Olympiacos | 0:2 | ||||
| 33. Jornada | 23.05.1999 | AEK Athen | - | Skoda Xanthi | 2:1 | |
|||
| 34. Jornada | 30.05.1999 | Skoda Xanthi | - | Apollon Smyrnis | 1:0 |
Grecia