| 9. Jornada | 21.09.2016 | Concordia Chiajna | - | FC Botoşani | 0:2 | ||||
| 10. Jornada | 24.09.2016 | CS Universitatea Craiova | - | FC Botoşani | 1:0 |  |
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| 11. Jornada | 01.10.2016 | FC Botoşani | - | Dinamo Bucureşti | 2:1 | ||||
| 16. Jornada | 18.11.2016 | FC Botoşani | - | FC Voluntari | 0:1 | ||||
| 17. Jornada | 27.11.2016 | FC Steaua Bucureşti | - | FC Botoşani | 0:0 | |
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| 18. Jornada | 30.11.2016 | FC Botoşani | - | Gaz Metan Mediaş | 0:0 | |
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| 20. Jornada | 10.12.2016 | FC Botoşani | - | CSM Politehnica Iași | 1:3 | |
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| 21. Jornada | 19.12.2016 | FC Viitorul Constanța | - | FC Botoşani | 3:1 | ||||
| 22. Jornada | 05.02.2017 | FC Botoşani | - | Concordia Chiajna | 1:1 |
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