| 18. Jornada | 23.01.1999 | FC Carl Zeiss Jena | - | FC Berlin | 1:0 |  |
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| 19. Jornada | 30.01.1999 | FC Berlin | - | Erzgebirge Aue | 2:0 | ||||
| 21. Jornada | 13.02.1999 | FC Berlin | - | Spandauer SV | 1:0 | |
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| 23. Jornada | 27.02.1999 | FC Berlin | - | Stahl Eisenhüttenstadt | 6:1 | ||||
| 24. Jornada | 06.03.1999 | SV Babelsberg 03 | - | FC Berlin | 0:0 | |
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| 20. Jornada | 10.03.1999 | FSV Zwickau | - | FC Berlin | 3:2 | |
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| 27. Jornada | 02.04.1999 | FC Berlin | - | Dynamo Dresden | 2:1 | ||||
| 28. Jornada | 05.04.1999 | VFC Plauen | - | FC Berlin | 2:0 | ||||
| 29. Jornada | 10.04.1999 | FC Berlin | - | Chemnitzer FC | 0:2 | ||||
| 30. Jornada | 17.04.1999 | Dresdner SC | - | FC Berlin | 1:2 | ||||
| 31. Jornada | 24.04.1999 | FC Berlin | - | 1. FC Magdeburg | 1:2 | |
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| 33. Jornada | 08.05.1999 | 1. FC Union Berlin | - | FC Berlin | 0:2 | ||||
| 34. Jornada | 15.05.1999 | FC Berlin | - | Rot-Weiß Erfurt | 3:1 |
Polonia