| Grupo D | 21.08.1988 | Atalanta | - | Taranto FC | 3:0 | ||||
| Grupo D | 24.08.1988 | Cosenza Calcio | - | Atalanta | 1:2 | ||||
| Grupo D | 28.08.1988 | Atalanta | - | Juventus | 1:1 | ||||
| Grupo D | 03.09.1988 | SS L.R. Vicenza | - | Atalanta | 2:1 | ||||
| Grupo 4 | 14.09.1988 | Sampdoria | - | Atalanta | 1:0 | ||||
| Grupo 4 | 21.09.1988 | AC Monza | - | Atalanta | 1:2 |  |
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| Grupo 4 | 28.09.1988 | Atalanta | - | AS Bari | 3:1 | |
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| Cuartos de final | 04.01.1989 | Atalanta | - | Lazio | 2:0 | ||||
| Cuartos de final | 25.01.1989 | Lazio | - | Atalanta | 3:2 | ||||
| Semifinales | 01.02.1989 | Atalanta | - | Sampdoria | 2:3 |
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