| 18. Jornada | 17.02.2024 | HNK Šibenik | - | NK Sesvete | 3:0 |  |
|||
| 19. Jornada | 24.02.2024 | NK Dugopolje | - | HNK Šibenik | 0:0 | ||||
| 20. Jornada | 02.03.2024 | HNK Šibenik | - | NK Croatia Zmijavci | 2:1 | ||||
| 21. Jornada | 09.03.2024 | NK Dubrava | - | HNK Šibenik | 0:3 |  |
|||
| 22. Jornada | 16.03.2024 | HNK Šibenik | - | NK Jarun | 2:0 | ||||
| 23. Jornada | 24.03.2024 | HNK Šibenik | - | HNK Cibalia | 1:0 | |
|||
| 24. Jornada | 02.04.2024 | NK Croatia Zmijavci | - | HNK Šibenik | 0:3 | ||||
| 25. Jornada | 07.04.2024 | HNK Šibenik | - | HNK Orijent Rijeka | 1:0 | ||||
| 26. Jornada | 14.04.2024 | NK BSK Bijelo Brdo | - | HNK Šibenik | 1:3 | ||||
| 27. Jornada | 20.04.2024 | HNK Šibenik | - | NK Solin | 2:1 | ||||
| 29. Jornada | 04.05.2024 | HNK Šibenik | - | NK Jarun | 2:0 | ||||
| 30. Jornada | 10.05.2024 | NK Sesvete | - | HNK Šibenik | 0:4 | ||||
| 31. Jornada | 19.05.2024 | HNK Šibenik | - | NK Vukovar 91 | 2:1 | |
|||
| 33. Jornada | 02.06.2024 | Zrinski Osječko | - | HNK Šibenik | 0:2 | |
Croacia