| 1. Jornada | 06.08.2006 | Colón de Santa Fe | - | Independiente | 1:4 |  |
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| 2. Jornada | 13.08.2006 | Independiente | - | Belgrano | 3:1 | ||||
| 3. Jornada | 19.08.2006 | Boca Juniors | - | Independiente | 1:0 | |
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| 4. Jornada | 27.08.2006 | Independiente | - | Banfield | 2:1 | |
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| 6. Jornada | 10.09.2006 | CA Lanús | - | Independiente | 2:4 | ||||
| 7. Jornada | 17.09.2006 | Independiente | - | San Lorenzo | 0:1 | |
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| 8. Jornada | 23.09.2006 | Estudiantes | - | Independiente | 2:1 | ||||
| 9. Jornada | 01.10.2006 | Independiente | - | Gimnasia de La Plata | 3:0 | |
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| 10. Jornada | 07.10.2006 | Godoy Cruz | - | Independiente | 3:1 | ||||
| 11. Jornada | 15.10.2006 | Independiente | - | Nueva Chicago | 3:2 | |
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| 13. Jornada | 29.10.2006 | Independiente | - | River Plate | 0:0 | |
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| 14. Jornada | 05.11.2006 | Newell's Old Boys | - | Independiente | 0:1 | ||||
| 15. Jornada | 12.11.2006 | Independiente | - | Racing Club | 2:0 | |
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| 16. Jornada | 18.11.2006 | Argentinos Juniors | - | Independiente | 2:0 | |
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| 17. Jornada | 26.11.2006 | Independiente | - | Arsenal de Sarandí | 2:1 | ||||
| 18. Jornada | 02.12.2006 | Quilmes | - | Independiente | 1:3 | |
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| 19. Jornada | 08.12.2006 | Independiente | - | Gimnasia de Jujuy | 1:2 | |
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