| Grupo B | 19.08.2016 | Universidad Técnica | - | Universidad San Martín | 5:0 | ||||
| Grupo B | 11.09.2016 | Universidad San Martín | - | Alianza Lima | 3:0 | ||||
| Grupo B | 18.09.2016 | Alianza Atlético | - | Universidad San Martín | 2:3 | ||||
| Grupo B | 23.09.2016 | Universidad San Martín | - | Comerciantes Unidos | 1:1 | ||||
| Grupo B | 27.09.2016 | Sport Huancayo | - | Universidad San Martín | 3:0 | ||||
| Grupo B | 18.10.2016 | Universidad San Martín | - | Universidad Técnica | 6:0 |  |
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| Grupo B | 27.10.2016 | Universidad San Martín | - | Universitario de Deportes | 4:4 | ||||
| Grupo B | 30.10.2016 | Alianza Lima | - | Universidad San Martín | 1:2 | ||||
| Grupo B | 02.11.2016 | Universidad San Martín | - | Alianza Atlético | 3:1 | |
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| Grupo B | 21.11.2016 | Comerciantes Unidos | - | Universidad San Martín | 5:1 | |
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| Grupo B | 24.11.2016 | Universidad San Martín | - | Sport Huancayo | 1:0 | ||||
| Grupo B | 27.11.2016 | Universitario de Deportes | - | Universidad San Martín | 0:1 |
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