| 5. Jornada | 15.09.2024 | KF Shkupi | - | KF Shkëndija 79 | 1:1 | ||||
| 9. Jornada | 05.10.2024 | Sileks Kratovo | - | KF Shkëndija 79 | 0:0 |  |
|||
| 16. Jornada | 27.11.2024 | KF Shkëndija 79 | - | KF Shkupi | 2:0 | ||||
| 17. Jornada | 03.12.2024 | FK Voska Sport | - | KF Shkëndija 79 | 0:1 | ||||
| 26. Jornada | 06.04.2025 | GFK Tikvesh | - | KF Shkëndija 79 | 0:1 | ||||
| 30. Jornada | 04.05.2025 | FC Struga | - | KF Shkëndija 79 | 1:1 |
Macedonia del Norte