| 1. Jornada | 21.08.2016 | UD Logroñés | - | SD Leioa | 1:1 |  |
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| 4. Jornada | 11.09.2016 | CD Toledo | - | UD Logroñés | 1:0 | ||||
| 5. Jornada | 18.09.2016 | UD Logroñés | - | UD Socuéllamos | 2:0 |  |
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| 6. Jornada | 24.09.2016 | SD Zamudio | - | UD Logroñés | 2:0 | ||||
| 7. Jornada | 02.10.2016 | UD Logroñés | - | Bilbao Athletic | 5:3 | ||||
| 8. Jornada | 09.10.2016 | Barakaldo CF | - | UD Logroñés | 0:0 | ||||
| 9. Jornada | 16.10.2016 | UD Logroñés | - | Sestao River | 1:1 | ||||
| 10. Jornada | 22.10.2016 | Arenas de Getxo | - | UD Logroñés | 1:2 | |
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| 11. Jornada | 29.10.2016 | Albacete | - | UD Logroñés | 1:0 | |
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| 12. Jornada | 02.11.2016 | UD Logroñés | - | UD SS Reyes | 0:0 | ||||
| 13. Jornada | 06.11.2016 | CDA Navalcarnero | - | UD Logroñés | 2:1 | ||||
| 14. Jornada | 13.11.2016 | UD Logroñés | - | CD Mensajero | 1:2 | |
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| 18. Jornada | 11.12.2016 | UD Logroñés | - | SD Amorebieta | 2:1 |
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