| 1. Jornada | 23.08.1998 | Panathinaikos | - | Paniliakos Pyrgos | 2:1 | ||||
| 5. Jornada | 26.09.1998 | Panathinaikos | - | Ionikos Nikea | 2:1 | ||||
| 6. Jornada | 04.10.1998 | Aris Saloniki | - | Panathinaikos | 0:1 | ||||
| 7. Jornada | 26.10.1998 | Panathinaikos | - | AO Kavala | 6:2 | ||||
| 13. Jornada | 13.12.1998 | AEK Athen | - | Panathinaikos | 2:0 | ||||
| 26. Jornada | 19.04.1999 | Panathinaikos | - | Ethnikos Piraeus | 5:1 | ||||
| 34. Jornada | 30.05.1999 | OFI Heraklion | - | Panathinaikos | 2:3 |
Grecia