| 20. Jornada | 28.01.2017 | Hansa Rostock | - | Jahn Regensburg | 0:0 |  |
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| 21. Jornada | 05.02.2017 | Preußen Münster | - | Hansa Rostock | 3:1 | ||||
| 22. Jornada | 11.02.2017 | SG Sonnenhof Großaspach | - | Hansa Rostock | 1:1 | ||||
| 23. Jornada | 19.02.2017 | Hansa Rostock | - | Hallescher FC | 1:0 | |
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| 24. Jornada | 25.02.2017 | FSV Frankfurt | - | Hansa Rostock | 0:0 | ||||
| 25. Jornada | 04.03.2017 | Hansa Rostock | - | VfR Aalen | 1:1 |  |
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| 26. Jornada | 11.03.2017 | Sportfreunde Lotte | - | Hansa Rostock | 2:0 | |
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| 27. Jornada | 15.03.2017 | Hansa Rostock | - | Fortuna Köln | 1:1 | ||||
| 28. Jornada | 20.03.2017 | FSV Zwickau | - | Hansa Rostock | 2:2 | ||||
| 29. Jornada | 25.03.2017 | Hansa Rostock | - | SC Paderborn 07 | 1:1 | ||||
| 32. Jornada | 09.04.2017 | Mainz II | - | Hansa Rostock | 2:4 | ||||
| 33. Jornada | 15.04.2017 | Hansa Rostock | - | 1. FC Magdeburg | 1:1 |
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