| 17. Jornada | 10.01.2009 | Panionios GSS | - | Panserraikos | 2:0 | ||||
| 18. Jornada | 18.01.2009 | OFI Heraklion | - | Panionios GSS | 2:0 | ||||
| 19. Jornada | 25.01.2009 | AEK Athen | - | Panionios GSS | 3:0 | ||||
| 25. Jornada | 07.03.2009 | Iraklis Saloniki | - | Panionios GSS | 2:1 | ||||
| 26. Jornada | 15.03.2009 | Levadiakos | - | Panionios GSS | 1:1 | ||||
| 27. Jornada | 22.03.2009 | Panionios GSS | - | Olympiacos | 2:3 | ||||
| 28. Jornada | 05.04.2009 | AE Lárissa | - | Panionios GSS | 0:0 |  |
|||
| 29. Jornada | 12.04.2009 | Panionios GSS | - | Thrasyvoulos Fylis | 4:1 |
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