| Primera etapa | 21.06.2003 | 1. FC Brno | - | FC Kotayk | 1:0 | ||||
| Primera etapa | 28.06.2003 | FC Kotayk | - | 1. FC Brno | 3:2 | ||||
| Segunda etapa | 05.07.2003 | FC Thun | - | 1. FC Brno | 2:3 |  |
|||
| Segunda etapa | 12.07.2003 | 1. FC Brno | - | FC Thun | 1:1 | ||||
| Tercera ronda | 19.07.2003 | Guingamp | - | 1. FC Brno | 2:1 | ||||
| Tercera ronda | 26.07.2003 | 1. FC Brno | - | Guingamp | 4:2 pró. | ||||
| Semifinales | 30.07.2003 | 1. FC Brno | - | Villarreal | 1:1 | ||||
| Semifinales | 06.08.2003 | Villarreal | - | 1. FC Brno | 2:0 |
Eslovaquia