| 17. Jornada | 14.06.2009 | Total Chalaco | - | FBC Melgar | 3:2 | ||||
| 18. Jornada | 21.06.2009 | FBC Melgar | - | Inti Gas | 0:2 | ||||
| 20. Jornada | 04.07.2009 | FBC Melgar | - | Universidad San Martín | 1:0 | ||||
| 21. Jornada | 12.07.2009 | CN Iquitos | - | FBC Melgar | 1:0 | ||||
| 22. Jornada | 19.07.2009 | José Gálvez | - | FBC Melgar | 1:1 |  |
|||
| 23. Jornada | 26.07.2009 | FBC Melgar | - | Sport Huancayo | 1:0 | ||||
| 24. Jornada | 29.07.2009 | FBC Melgar | - | Alianza Atlético | 2:1 | ||||
| 25. Jornada | 02.08.2009 | Sport Áncash | - | FBC Melgar | 2:2 | ||||
| 26. Jornada | 09.08.2009 | Universitario de Deportes | - | FBC Melgar | 1:0 | ||||
| 27. Jornada | 16.08.2009 | FBC Melgar | - | Sporting Cristal | 1:0 | ||||
| 28. Jornada | 20.08.2009 | FBC Melgar | - | César Vallejo | 1:1 | |
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| 30. Jornada | 29.08.2009 | FBC Melgar | - | Juan Aurich | 1:3 | ||||
| 29. Jornada | 02.09.2009 | Coronel Bolognesi | - | FBC Melgar | 3:2 |
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