| 18. Jornada | 26.02.2012 | Viktoria Plzeň | - | FK Dukla Praha | 1:1 | ||||
| 19. Jornada | 02.03.2012 | FK Dukla Praha | - | 1. FC Slovácko | 2:0 | ||||
| 20. Jornada | 11.03.2012 | FC Hradec Králové | - | FK Dukla Praha | 0:2 | ||||
| 22. Jornada | 23.03.2012 | 1. FK Příbram | - | FK Dukla Praha | 2:2 | ||||
| 23. Jornada | 01.04.2012 | FK Dukla Praha | - | Slovan Liberec | 1:2 | ||||
| 24. Jornada | 06.04.2012 | FK Dukla Praha | - | Bohemians 1905 | 2:0 | ||||
| 25. Jornada | 15.04.2012 | FK Baumit Jablonec | - | FK Dukla Praha | 0:2 | ||||
| 27. Jornada | 29.04.2012 | FK Dukla Praha | - | FK Mladá Boleslav | 1:2 | ||||
| 29. Jornada | 09.05.2012 | FK Dukla Praha | - | Sparta Praga | 1:1 | ||||
| 30. Jornada | 12.05.2012 | Sigma Olomouc | - | FK Dukla Praha | 2:1 |
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